Edital de seleção | NICE-MEL

UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO PAULO (UNIFESP) ESCOLA PAULISTA DE MEDICINA DEPARTAMENTO DE MEDICINA – DISCIPLINA DE INFECTOLOGIA Gaia – Grupo de Análise em Infecções e Antimicrobianos

EDITAL DE SELEÇÃO – BOLSA DE PÓS-DOUTORADO EM GENÔMICA MICROBIANA E EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR

O Departamento de Medicina – Disciplina de Infectologia da Escola Paulista de Medicina da Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), por meio do Pesquisador Responsável pelo projeto, torna pública a abertura de inscrições para uma (01) vaga de Bolsa de Pós-Doutorado / Pesquisador de Projeto, destinada à atuação em um programa de pesquisa voltado à epidemiologia molecular, genômica microbiana, resistência aos antimicrobianos e integração de dados laboratoriais e epidemiológicos.

1. Visão Geral da Vaga

O(a) candidato(a) selecionado(a) contribuirá para as atividades científicas associadas ao projeto, incluindo planejamento experimental, integração e interpretação de dados genômicos, análises epidemiológicas, produção científica e desenvolvimento de colaborações nacionais e internacionais.

A bolsa está vinculada ao projeto NICEMEL (Neonatal ICU – Microbiome and Resistome), um estudo prospectivo multicêntrico de coorte clínica que investiga a dinâmica do microbioma, a metagenômica shotgun (WGS) e o resistoma aos antimicrobianos em recém-nascidos prematuros de muito baixo peso com sepse neonatal tardia. O estudo é desenvolvido em unidades de terapia intensiva neonatal da UNIFESP, UNICAMP e UNESP, em colaboração com laboratórios internacionais.

2. Escopo da Pesquisa

As atividades envolverão estreita interação com grupos de pesquisa colaboradores nacionais e internacionais participantes do projeto, bem como a coordenação de todos os componentes microbiológicos do estudo clínico. Essa função vai além das atividades laboratoriais de genômica microbiana e análise de dados biológicos, abrangendo planejamento científico, supervisão dos fluxos de coleta e processamento de amostras, coordenação das atividades laboratoriais, garantia da qualidade e integração das atividades microbiológicas ao longo de toda a fase clínica do projeto.

Em razão do delineamento longitudinal do estudo, o(a) pesquisador(a) selecionado(a) atuará inicialmente no Brasil como coordenador(a) científico(a) dos componentes microbiológicos do projeto, supervisionando as atividades laboratoriais durante o recrutamento dos participantes e a coleta de amostras.

Essa etapa poderá seguir após aprovação FAPESP seguida por um período de pesquisa internacional na Harvard Medical School, nos Estados Unidos, onde o(a) candidato(a) desenvolverá atividades de genômica microbiana, bioinformática e análises integradas dos dados biológicos gerados pelo projeto.

Durante essa fase, o(a) pesquisador(a) participará de um projeto dedicado ao estudo de microrganismos de relevância clínica e para a saúde pública por meio de abordagens integradas envolvendo:

a) genômica microbiana, metagenômica shotgun (WGS) e caracterização do microbioma por sequenciamento de amplicons (16S rRNA e ITS) aplicados a amostras clínicas e ambientais;

b) caracterização do resistoma aos antimicrobianos em recém-nascidos prematuros e em ambientes de unidades de terapia intensiva neonatal;

c) análise de dados biológicos em larga escala;

d) bioinformática aplicada;

e) integração de bases de dados laboratoriais, clínicas e epidemiológicas;

f) divulgação científica e publicação dos resultados da pesquisa.

3. Duração da Bolsa e Mobilidade Internacional

A bolsa terá duração prevista de até 24 meses, com possibilidade de renovação por até 24 meses adicionais, condicionada às normas vigentes da agência financiadora e à avaliação satisfatória do desempenho do(a) bolsista.

A bolsa será financiada no âmbito do Projeto FAPESP nº 2024/14614-5 e compreenderá uma bolsa mensal no valor de R$ 12.570,00 (nível Pós-Doutorado), em conformidade com as normas da FAPESP, além dos recursos de pesquisa previstos pela agência de fomento.

Como parte integrante das atividades propostas, o(a) candidato(a) selecionado(a) poderá realizar, após aprovação da FAPESP, um período de pesquisa no exterior (”estágio sanduíche”) de até doze (12) meses (ou conforme normas vigentes no momento da concessão) em um laboratório colaborador nos Estados Unidos, de acordo com o cronograma do projeto e condicionado às aprovações institucionais e à disponibilidade de financiamento.

4. Requisitos de Elegibilidade

Os(as) candidatos(as) deverão:

I. Possuir título de Doutor (ou certificado de conclusão de doutorado) obtido em instituição reconhecida, em área compatível com a proposta do projeto;

II. Demonstrar experiência prévia em pesquisa científica;

III. Demonstrar experiência prática prévia em genômica microbiana, incluindo análise de dados de sequenciamento preferencialmente com experiência em Staphylococcus aureus e outros Gram positivos (por exemplo, WGS e metagenômica) e/ou fluxos de trabalho em bioinformática (requisito obrigatório);

IV. Demonstrar proficiência em língua inglesa (escrita e oral), necessária para o período de pesquisa internacional e para as atividades de publicação científica;

V. Demonstrar disponibilidade e interesse para atuar em um ambiente multidisciplinar altamente colaborativo, coordenando todos os aspectos microbiológicos do estudo clínico desde sua implementação inicial, incluindo organização laboratorial, supervisão do fluxo de amostras e interação com os centros participantes, antes do início das atividades de genômica microbiana e análise de dados biológicos.

As seguintes qualificações serão consideradas diferenciais:

a) experiência em pesquisa em microbioma;

b) experiência em análise comparativa de genomas bacterianos;

c) experiência na utilização de ferramentas baseadas em Linux para análise de genomas microbianos, bem como dos softwares R, QIIME, Mothur e DADA2;

d) experiência em epidemiologia molecular, resistência aos antimicrobianos ou vigilância genômica;

e) experiência em programação, análise estatística ou ciência de dados;

f) experiência com experimentos de sequenciamento de nova geração utilizando plataformas Illumina e/ou Oxford Nanopore Technologies;

g) histórico relevante de publicações científicas;

h) experiência prévia em colaborações científicas internacionais;

i) Experiência preferencialmente com estudos em Staphylococcus aureus; outros Gram positivos e Gram-negativos de relevância clínica também serão considerados.

5. Processo de Inscrição

Período de inscrições: 13/10/2026 a 10/11/2026.

As inscrições deverão ser realizadas exclusivamente por meio eletrônico para:

Contato:

contact@nice-mel.org

Assunto do e-mail:

Inscrição – Bolsa de Pós-Doutorado – [Nome do(a) Candidato(a)]

Documentos obrigatórios para inscrição:

a) Formulário de Inscrição devidamente preenchido;

b) Currículo atualizado (Currículo Lattes e/ou currículo internacional equivalente);

c) Carta de interesse (máximo de duas páginas);

d) Até três publicações consideradas pelo(a) candidato(a) como as mais relevantes de sua trajetória científica;

e) Documentação complementar que o(a) candidato(a) julgar pertinente;

f) Nome e informações de contato de dois(as) pesquisadores(as) que possam atuar como referências acadêmicas e que poderão ser contatados durante o processo seletivo.

6. Processo Seletivo

O processo seletivo poderá incluir:

I. Análise da documentação apresentada;

II. Avaliação da aderência da trajetória científica do(a) candidato(a) aos objetivos do projeto;

III. Entrevista técnica;

IV. Discussão sobre a experiência prévia em pesquisa e as perspectivas de desenvolvimento científico do(a) candidato(a).

Informações ou documentos adicionais poderão ser solicitados, caso necessário.

7. Critérios de Avaliação

As candidaturas serão avaliadas considerando:

a) consistência e qualidade da trajetória científica;

b) domínio técnico e metodológico;

c) potencial de contribuição para os objetivos do projeto;

d) capacidade de trabalho independente e de colaboração científica;

e) alinhamento entre a experiência prévia do(a) candidato(a) e as atividades propostas;

f) potencial de desenvolvimento acadêmico e de inserção internacional.

A classificação final será baseada em uma avaliação global dos documentos apresentados.

8. Comissão de Seleção

A Comissão de Seleção será composta pelo(a) Pesquisador(a) Responsável pelo projeto e por dois membros adicionais da equipe do projeto, designados pelo(a) próprio(a) Pesquisador(a) Responsável.

As decisões da Comissão serão finais e fundamentadas em critérios de avaliação científica e técnica.

9. Cronograma

Publicação do edital: 13/10/2026

Período de inscrições: 13/10/2026 a 10/11/2026

Divulgação das inscrições deferidas: 11/11/2026

Período de avaliação e entrevistas: 12/11/2026 a 18/11/2026

Divulgação do resultado final: 19/11/2026

Previsão de início das atividades: 01/12/2026

10. Disposições Finais

Os casos omissos neste Edital serão resolvidos pelo(a) Pesquisador(a) Responsável e pela equipe do projeto.

O presente Edital poderá ser alterado, suspenso ou cancelado em razão da disponibilidade de recursos financeiros, de exigências institucionais ou de necessidades relacionadas ao desenvolvimento do projeto.